（1）改良土壤，增加土壤肥力，促进植物对营养元素的吸收

有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的 0.1%与植物黏液、矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下还能参与腐殖质形成。

氮、磷、钾大量营养元素：根瘤菌、自生和联合固氮菌；硅酸盐细菌的解钾作用。

土壤中大量微生物的活动使土壤有机质转化形成腐殖质，促进土壤团粒结构的形成，提高土壤肥力，改善土壤理化形状，增强土壤保肥、保水能力，从而提髙作物的产量和品质。

（2）分泌多种生理活性物质刺激调节植物生长

大量研究表明，微生物活动产生的植物生长调节物质以及维生素都不同程度地刺激和调节植物的生长。

分泌植物激素：生长素、赤霉素、脱落酸、乙烯和酚类物质。

酸类物质的产生：有机酸的作用。

（3）对有害微生物起到生物防治作用

通过在植物根际大量生长繁殖成为作物根际的优势菌，与病原微生物争夺营养物质，在空间上限制其他病原微生物的繁殖机会，对病原微生物起到挤压、抑制作用，从而减轻病害。这类微生物也叫做根圈促生细菌（PG-PR）。

(4)产生抗病和抗逆作用，间接促进植物生长

产生多种抗病物质，如抗生素等。提高植物的抗逆性：由于微生物肥料的施用，其所含的菌种能诱导作物产生超氧化物歧化酶，在植物受到病害、虫害、干旱、衰老等逆境时消除因逆境而产生的自由基来提高作物的抗逆性，减轻病害。在根部附近区域大量繁殖，变为优势种群，抑制或减少了病原微生物的繁殖，有些还有拮抗病原微生物的作用，减少了有害病原的危害；菌种活动区能增加水分吸收，提高作物抗旱能力。

（5）减少资源和环境的污染

可以减少不合理使用化肥造成的水体污染，有利于发 展生态农业和保护环境。